פנחס כהן נולד בזכרון יעקב וגדל במטולה. בוגר בית הספר החקלאי במקווה ישראל ולמד אגרונומיה בברלין.  כהן ייסד את בית הספר "אבטליה", בית הספר העברי הראשון בחיפה, שממנו צמח בית הספר הריאלי. תחילה התנהלו הלימודים תחת עץ במושבה הגרמנית ולאחר מכן הועתקו לבית שלח ברחוב חורי בחיפה
.עת חזרתו מלימודי מדעי טבע בברלין, החל ללמד טבע והיה מורה אהוב ונערץ על תלמידיו
כהן היה ממייסדי שכונת בת גלים. בשנת 1916 יסד את אגודת המשוטטים שממנה צמחה החברה להגנת הטבע. כהן ייסד את שבט המשוטטים שהיווה את גרעין תנועת הצופים

​

חזונו להקים מכון ביולוגי, גן בוטני וזואולוגי על הר הכרמל התממש בשנת 1949 כשקיבל מוועד הר הכרמל את מרתף בית הכנסת בו הקים את המכון הביולוגי בית פנחס, שכלל פינת חי קטנה. מפינת חי זו צמח גן החיות בחיפה, שכהן היה למנהלו הראשון. בשנת 1955 הסתיימה הקמתו של בנין המכון הביולוגי בתוך השטח החדש של גן החיות, אחרי פטירתו של פנחס כהן הוחלט, כאות הערכה לפועלו, לקרוא למכון  ביולוגי
"בית פנחס". חזונו קם והתממש: המכון הביולוגי פתח למורים קורסים במטרה להרחיב את ידיעותיהם במקצוע הטבע תוך התנסות ומחקר. המכון סיפק לבתי הספר בעיר ובסביבה חומר חי והווה מרכז לייעוץ     בתחומי הטבע . הגנים, הזאולוגי והבוטני שימשו כגנים מדעיים וציבוריים לקהל הרחב והיוו גורם התפתחות חשוב  לקהילה בכרמל ובסביבתה